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Amazonas - Rede Proteômica do Amazonas - Análise proteômica do fruto e semente do guaranazeiro (Paullinia cupana);
Bahia - Rede Integrada de Estudos Genômicos e Proteômicos – Rede Proteômica do Estado da Bahia – Fungo Crinipellis perniciosa e sua interação com T. cacao.
Goiás - Estratégias proteômicas para o estudo da parede celular e membrana de Paracoccidioides basiliensis;
Minas Gerais - Proteoma estrutural e funcional do veneno do escorpião amarelo Tityus serrulatus; e
Santa Catarina - Genoprot – Rede Integrada de Estudos Genômicos e Proteômicos – Rede Proteoma de Santa Catarina (RPSC): Proteômica de micoplasmas de interesse em suinocultura