Amazonas - Rede Proteômica do Amazonas: Análise proteômica de C. violaceum – peptídeos e proteínas com potencial biotecnológico;
Bahia – Estudo do proteoma de Crinipellis perniciosa;
Ceará - Identificação e caracterização de genes envolvidos na resistência de feijão-de-corda a estresses bióticos e abióticos, através da proteômica e genômica funcional;
Goiás - Proteomas de interesse médico e biotecnológico: Paraccoccidioides brasilienses e arroz;
Minas Gerais - Proteoma estrutural e funcional do veneno do escorpião amarelo Tityus serrulatus;
Pará - Proteoma do músculo esquelético do búfalo;
Paraná - Análise proteômica do estresse hídrico em cafeeiro;
Rio de Janeiro - Consolidação da Rede de Pesquisa em Proteoma do Estado do Rio de Janeiro
Rio Grande do Sul - Implantação de análise proteômica no RS;
São Paulo - Rede Proteoma do Estado de São Paulo; e
Santa Catarina - Análise proteômica de Mycoplasmas de interesse em suinocultura.