A Coordenação Geral de Biodiversidade – CGBD – tem como missão subsidiar a definição de estratégias para a implementação de programas, projetos e atividades de fomento, bem como promover a articulação entre as diferentes iniciativas voltadas para a pesquisa em biodiversidade. Acompanha estudos e pesquisas sobre a biodiversidade brasileira visando a definição de políticas públicas em C,T&I para conversação e exploração sustentável dos recursos biológicos. Busca ainda induzir a elaboração de modelos que estabeleçam as relações adequadas entre os fatores ambientais e a biodiversidade, considerando as alterações das comunidades florísticas e faunísticas e as mudanças ambientais. A CGBD coordena a implementação de programas estruturados em redes de pesquisa: Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio); Rede de Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal (Bionorte). Representa o MCT na Convenção das Nações Unidas sobre Diversidade Biológica. Além dessas ações, a CGBD representa o MCT em vários grupos de trabalho e comissões sobre o meio ambiente, ciência e tecnologia, com destaque para o Conselho Nacional de Biodiversidade (CONABIO), e o Conselho Gestor do Patrimônio Genético (CGEN).