A Assessoria de Coordenação dos Fundos Setoriais - ASCOF tem por finalidade assessorar o Secretário-Executivo nos assuntos relacionados com o financiamento de programas e projetos de desenvolvimento científico e tecnológico, estabelecendo normas e procedimentos; planejar; coordenar e supervisionar estudos; divulgar calendários de chamadas públicas e outros instrumentos de seleção de propostas; e coordenar a articulação com as agências do Ministério e entidades relacionadas.