A Coordenação-Geral de Cooperação Internacional – CGCI tem por finalidade participar, estudar, propor e articular mecanismos de  negociação, acompanhar a execução de instrumentos de cooperação internacional, elaborar estudos com vistas à identificação das oportunidades de cooperação internacional, acompanhar os trabalhos no âmbito das Nações Unidas e coordenar e orientar a participação e a representação do Ministério da Ciência e Tecnologia, unidades de pesquisa e entidades vinculadas em negociações internacionais, em estreita coordenação com o Ministério das Relações Exteriores.