Os Fundos Setoriais estão alocando o montante de R$ 47 milhões  em ações na Amazônia, para apoiar a execução de projetos  de pesquisa na região, destes R$ 15 milhões são para projetos institucionais de implementação de infra-estrutura física para pesquisa e pós-graduação. O restante, R$32 milhões são para apoiar atividades de pesquisa científica, tecnológica e de inovação de grupos de pesquisa, consolidados e emergentes; atividades de formação e fixação de recursos humanos e de pesquisa nas áreas de biotecnologia, biodiesel, microeletrônica, software, engenharia de telecomunicações, e energia.

SETEF, 04/04/2006