Instituída pelo Art. 13 da Portaria nº 397, de 05/06/2012, a Comissão Permanente de Monitoramento e Avaliação (CPMA) é o órgão colegiado responsável pela execução da Política de Monitoramento e Avaliação, composta por representantes do Gabinete do Ministro, da Secretaria-Executiva, das Secretarias finalísticas, da Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP), do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), da Comissão Nacional de Energia Nuclear (CNEN) e da Agência Espacial Brasileira (AEB).